原標(biāo)題:已服務(wù)全球200余位科學(xué)家,可將新藥研發(fā)周期縮短九成 孝感“算力魔方”來了
長(zhǎng)江3D科學(xué)計(jì)算中心相關(guān)負(fù)責(zé)人正在查看3D科學(xué)計(jì)算機(jī)運(yùn)行情況。
7月29日,位于孝感高新區(qū)的長(zhǎng)江3D科學(xué)計(jì)算中心,12臺(tái)3D科學(xué)計(jì)算機(jī)整齊排列,陣列式燈帶在機(jī)箱表面閃爍流動(dòng),伴隨著低沉穩(wěn)定的機(jī)器嗡鳴聲,龐大的算力正全速運(yùn)轉(zhuǎn)。
“每臺(tái)整機(jī)由512顆高性能國(guó)產(chǎn)芯片協(xié)同運(yùn)算構(gòu)成,單機(jī)算力是傳統(tǒng)超算的100倍以上,耗電量卻只有其1/150!痹撝行捻(xiàng)目總監(jiān)杜康介紹,中心于去年4月開建,今年4月投產(chǎn),5月順利通過中國(guó)信息通信研究院CE-S5和CP-S5等級(jí)認(rèn)證,算效和算力雙雙達(dá)到國(guó)內(nèi)最高等級(jí),有效破解“算不了、算不起、算不完”等三大難題。
作為國(guó)內(nèi)首批實(shí)現(xiàn)軟硬件全國(guó)產(chǎn)化的國(guó)家級(jí)商用科學(xué)計(jì)算中心,長(zhǎng)江3D科學(xué)計(jì)算中心在分子動(dòng)力學(xué)模擬仿真達(dá)到微秒水平,支持藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、小分子化合物的篩選等生物醫(yī)藥關(guān)鍵環(huán)節(jié),還可為新材料研發(fā)、高端裝備設(shè)計(jì)提供高效算力支撐。
“比如研發(fā)新藥,以前需要約10年、10億美元。在長(zhǎng)江3D科學(xué)計(jì)算中心超強(qiáng)算力加持下,我們現(xiàn)在可以把研發(fā)周期縮短約90%、成本降低約90%!倍趴涤靡唤M數(shù)據(jù)解釋了“超級(jí)引擎”帶來的效率變革。
實(shí)現(xiàn)性能飛躍的秘訣在于,自主創(chuàng)新的國(guó)產(chǎn)計(jì)算內(nèi)核以及3D全互聯(lián)的計(jì)算架構(gòu)創(chuàng)新!拔覀儾捎萌碌膰(guó)產(chǎn)芯片架構(gòu),對(duì)比傳統(tǒng)的CPU、GPU,沒有交換機(jī)網(wǎng)絡(luò),全部以芯片立體方式構(gòu)成,實(shí)現(xiàn)了算力強(qiáng)、能耗低、成本省的突破!
在中心展示大屏上,顯示著一個(gè)蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)變化,這是他們正在研發(fā)一款新型JAK變構(gòu)抑制劑藥物,有望用于治療類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、胃癌、結(jié)直腸癌以及代謝性疾病等,有數(shù)百億元的市場(chǎng)前景。
該中心戰(zhàn)略負(fù)責(zé)人張澤宇說,他們?cè)谌蚴状瓮ㄟ^計(jì)算方式,發(fā)現(xiàn)了全新變構(gòu)位點(diǎn),從三億個(gè)虛擬化合物中發(fā)現(xiàn)了50個(gè)潛在變構(gòu)位點(diǎn)活性化合物。
國(guó)內(nèi)某高?蒲袌F(tuán)隊(duì)歷時(shí)五六年對(duì)某癌癥藥物分子展開研究,卻始終無法成藥。中心運(yùn)用1臺(tái)3D科學(xué)計(jì)算機(jī)開展分子動(dòng)力學(xué)長(zhǎng)時(shí)間模擬仿真,3個(gè)月即取得突破,將分子的體外活性從150微摩爾優(yōu)化至200納摩爾。目前,該小分子化合物正處于結(jié)構(gòu)優(yōu)化與臨床前驗(yàn)證階段,有望開發(fā)成為針對(duì)乳腺癌、非小細(xì)胞肺癌等腫瘤耐藥問題的新型靶向治療藥物。
此外,中心還幫助該?蒲袌F(tuán)隊(duì)攻克某款藥物的耐藥性研究瓶頸,有針對(duì)性開發(fā)新的癌癥耐藥結(jié)構(gòu),有望運(yùn)用于增強(qiáng)腫瘤免疫治療、誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡、治療阿爾茲海默癥等領(lǐng)域。
張澤宇介紹,中心投運(yùn)以來,已服務(wù)全球200余位科學(xué)家,助力15篇國(guó)際頂刊論文發(fā)表,推動(dòng)3款新藥進(jìn)入臨床前試驗(yàn)階段。今年,孝感正著手?jǐn)U容3D科學(xué)計(jì)算中心,計(jì)劃用3年時(shí)間將高性能計(jì)算機(jī)數(shù)量增至100臺(tái),為湖北算力規(guī)模突破20000P提供關(guān)鍵支撐。(文/圖 湖北日?qǐng)?bào)全媒記者 王欣 通訊員 墨紓 蔡青陽)

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